La validità diagnostica, i limiti e l’applicabilità nella clinica prenatale della NGPD risiede esclusivamente nella corretta “targetizzazione” della procedura diagnostica utilizzata.
Questo vuol dire che:
- L’elenco delle mutazioni responsabili delle malattie genetiche ricercate deve essere individuato con assoluta precisione non includendo o, addirittura escludendo, tutte le varianti geniche per le quali non vi è certezza di correlazione patogenetica, per le quali non vi è univocità di significato.
- La targettizzazione esclude tutte le mutazioni geniche per le quali non vi è eticamente la giustificazione di ricercare (suscettibilità, polimorfismi, ecc).
- La targettizzazione è un processo dinamico che si modifica a seconda dell’evoluzione e delle conoscenze genetiche e riflette quindi lo stato “consolidato” dell’arte;
- La targettizzazione può mutare da nazione a nazione in funzione dell’interesse geografico per alcune mutazioni. Può variare da laboratorio a laboratorio in considerazione della tecnologia utilizzata. Può variare in relazione alle convinzioni giuridiche ed etiche nel luogo in cui si esegue l’esame.
Come ben specificato nei consensi informati vengono individuate esclusivamente le anomalie genetiche derivanti da mutazioni oggi ritenute responsabili delle sindromi riportate nella prima colonna.
Si tratta di migliaia di mutazioni di sicuro significato patologico. Deve essere chiarito e ribadito che eventuali nuove anomalie non ancora conosciute dalla scienza medica o in fase di studio, o per le quali non vi è convalidata certezza di una correlazione clinica specifica, nota, descritta, e categorizzata, non verranno diagnosticate a priori per non ingenerare dubbi e sospetti privi di fondamento clinico.
Elenco targetizzato dei geni studiati mediante la NGPD: di questi geni verranno studiate circa 4000 mutazioni!
*N.B.: L’elenco delle mutazioni verrà riportato nella risposta definitiva. Si tratta di mutazioni che rappresentato, al momento attuale, quanto di più sicuramente conosciuto dagli attuali database sugli errori genetici associati alle patologie di seguito riportate:
Nella diagnosi prenatale con NGPD verranno studiate tutte le malattie cromosomiche e tutte le malattie da microdelezione e microduplicazione cromosomica il cui riarrangiamento abbia una risoluzione superiore ad 1 mb (megabase)* In genere si tratta di un’anomalia genetica “a sorpresa” che accade in una famiglia normale senza familiarità.** Per la maggior parte di tali patologie non è nota l’esatta incidenza. Essa varia da 1/1.000 e fino a condizioni molto rare.
Disordine genetico | Geni indagati |
Fibrosi Cistica | CFTR |
Sordità Congenita | GJB2 – GJB6 |
X Fragile | FMR1 |
SMA | SMN1 |
Distrofia Muscolare di Duchenne | DMD |
Distrofia Muscolare di Becker | DMD |
Inoltre le seguenti patologie a carattere mendeliano (esclusivamente se sostenute dalle mutazioni genetiche riportate in tabella) |
|
CROMOSOMOPATIE | |
Trisomia 21 (Sindrome di Down) | Sindrome da duplicazione 10q |
Trisomia 18 (Sindrome di Edwards) | Sindrome da delezione 11q |
Trisomia 13 (Sindrome di Patau) | Sindrome da delezione 13q |
Trisomia 8 | Sindrome da duplicazione 15q |
Trisomia 9 a mosaico | Sindrome da delezione 18p |
Triploidia | Sindrome da delezione 18q |
Sindrome da delezione 3p | Sindrome Cat-eye |
Sindrome da duplicazione 3q | Sindrome XYY (doppio Y) |
Sindrome da delezione 4p (Sindrome di Wolf-Hirschhorn) |
Sindrome di Klinefelter |
Sindrome da duplicazione 4q | Sindrome XXX (triplo X) |
Sindrome da delezione 5p (Sindrome del cri du chat) |
Sindrome di Turner (monosomia cromosoma X) |
Sindrome da delezione 9p | Altre anomalie numeriche |
DISORDINE SINDROMICO DA MICRODELEZIONE / MICRODUPLICAZIONE DEI LOCI RIPORTATI A LATERE | TRASMISSIONE | INCIDENZA | LOCUS GENETICO ESAMINATO |
Sindrome di Miller-Dieker | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | gene LIS1 – 17p13.3 |
Autismo X-Linked – gene NLGN4 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | Xp22.33 |
Sindrome di Axenfeld-Rieger | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | geni PITX2/ FOXC1 – 4q25-q26 |
Sex-determining region Y | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | gene SRY – Yp11.3 |
Sindrome di Beckwith-Wiedemann | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 11p15.5 |
Sindrome di Potocki-Shaffer | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 11p11.2 |
Sindrome di Prader Willi /Angelman Syndrome | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 15q11-q13 |
Sindrome Cat eye | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | geni CECR1; CECR5; CECR6;22q11 |
Sindrome di Rieger | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 14q25-q26 |
Sindrome di Charcot-Marie-Tooth disease type 1 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 17p11.2 |
Sindrome di Charcot-Marie-Tooth X-linked | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 1 Xq13.1 |
Sindrome di Rubinstein-Taybi | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 16p13.3 |
Sindrome di Saethre-Chotzen | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 7p21 |
Displasia Cleidocraniale | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 6p21 |
Sindrome di Cornelia de Lange | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 5p13.1 |
Sindrome di Simpson-Golabi-Behmel | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | Xq26 |
Cri du Chat Syndrome | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 5p15.2 |
Sindrome di Smith-Magenis | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 17p11.2 |
Sindrome di Dandy-Walker | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | gene ZIC1-ZIC4 – 3q24 |
Sindrome di Sotos | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 5q35 |
Sindrome di DiGeorge | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 22q11.2 |
Sindrome di DiGeorge regione 2 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 10p14-p13 |
Split-Hand/Foot Malformation 3 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 10q24 |
Split-Hand/Foot Malformation 4 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 3q27 |
Split-Hand/Foot Malformation 5 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 2q31 |
Malattia di Alzheimer ad esordio precoce | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 21q21 |
Sinpolidattilia/Sindattilia Tipe II | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 2q31-q32 |
Sindrome di Feingold | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 2p24.1 |
Sindrome di Greig | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 7p13 |
Sindrome di Van der Woude | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 1q32-q41 |
Sindrome di WAGR | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 11p13 |
Oloprosencefalia tipo 1 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 21q22.3 |
Oloprosencefalia tipo 2 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 2p21 |
Oloprosencefalia tipo 3 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 7q36 |
Sindrome di Williams | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 7q11.23 |
Sindrome di Wolf-Hirschhorn | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | gene WHSC – 4p16.3 |
Lissencefalia X-Linked | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | Xq22.3-q23 |
Discondrosteosi di Leri Weill | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | Xpter-p22.32 |
Sindrome di Kallmann tipo 1 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | gene KAL1 – Xp22.3 |
Sindrome di Kallmann tipo 2 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | gene KAL2 – 8p11.2-p11.1 |
Sindrome delezione terminale | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 14q (van Karnebeek) |
Delezione 1p36 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (monosomia 1p36) |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 2q37 |
Sindrome di Langer Giedion | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 8q24.11-q24.13 |
Sindrome Trico-Rino-Falangea | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 8q24.1 |
Sindrome di Jacobsen | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 11q23.1-q24.1 |
Sindrome Brachio-Oto-Renale | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 8q13.3 |
Displasia Campomelica | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 17q24.3 |
Sindrome di Cornelia De Lange | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 5p13.2 |
Sindrome di Johanson-Blizzard | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 15q15.2 |
Sindrome di Joubert tipo 4 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 2q13 |
Leucodistrofia metacromatica | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 22q13.33 |
Sindrome di Buschke-Ollendorff | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 12q14.2-q15 |
Sindrome da microdelezione | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 1q21.1 |
Sindrome da microdelezione | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 3q29 |
Sindrome da microdelezione | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 15q13.3 |
Sindrome da microdelezione | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 17q21.31 |
Sindrome da delezione distale | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 22q11.2 |
Aniridia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 11p13 |
Sindrome di Charge | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 8q12.2 |
Sindrome microftalmica tipo 7 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | Xp22.2 |
Sindrome del Rene Policistico Infantile Severa | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 16p13.3 |
Simpolidattilia tipo 1 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 2q31.1 |
Sindrome Velocardiofaciale | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 22q11.21 |
Tumore di Wilms | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 11p13 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 1q21.1 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 1q41q42 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 2p15p16.1 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 2p21 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 2q23.1 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 2q24 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 2q32 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 3q13 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 3q29 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 4q21 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 5q14.3 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 5q31.3 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 6p22 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 6q16 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 7q11.23 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 7q31 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 8p11.2 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 8p23.1 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 8q13 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 8q21.11 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 8q24.1 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 9q22.3 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 10p11.21p12.31 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 10q22.3q23.3 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 11p13 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 12p12.1 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 12q15q21.1 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 13q32 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 14q11.2 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 14q22q23 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 14q22-q23 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 15q11.2 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 15q13.3 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 16p11.2 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 16p11.2p12.2 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 16q24.3 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 17p13.3 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 17q21.31 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 17q23.1q23.2 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 19p13.12 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 19q13.1 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 20p12.3 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 20q13.33 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 21q22.11q22.12 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 21q22.13q22.2 |
Monosomia | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 22q11.2 distale |
Dup(1) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | q21.1 |
Dup(2) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q23.1) |
Dup(2) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q31.1) |
Dup(3) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q26) |
5 Dup(5) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q35) |
Dup(7) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p22.1) |
6 Dup(8) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p23.1) |
Dup(10) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q22.3q23.3) |
Dup(14) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q11.2) |
Dup(11) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | p(15.4) |
Dup(15) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q11q13) |
Dup(16) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p13.11) |
Dup(17) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p13.3) |
Dup(17) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q21.31) |
Dup(22) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q11.2) distale |
Dup(X) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p22.13p22.2) |
Dup(X) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q12-q13.3) |
Dup(X) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q27.3q28) |
Duplicazione | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | 22q11.2 |
Del(1) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p36) |
Del(1) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q21) |
Del(2) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q23.1) |
Del(2) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q32) |
Del(2) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q37) |
Del(3) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q13) |
Del(3) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q29) |
Del(4) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q21) |
Del(5) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q14.3) |
Del(6) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p22) |
Del(6) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q16) |
Del(6) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q25) |
Del(7) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q31) |
Del(12) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p12.1) |
Del(13) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q14) |
Del(13) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q34) |
Del(14) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q12) |
Del(15) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q14) |
Del(16) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p11.2) |
Del(16) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q24.3) |
Del(16) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p11.2p12.2) |
Del(16) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p13.11) |
Del(17) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q21.31) |
Del(17) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q11) |
Del(17) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q12) |
Del(17) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q23.1q23.2) |
6 Del(19) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p13.12) |
Del(19) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q13.11) |
Del(20) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p12.3) |
Del(20) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p13) |
1 Del(20) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q13.33) |
Duplicazione | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | Xp22 |
Del(21) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (q22.13q22.2) |
Del(X) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p21) |
Del(X) | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | (p23) |
Duplicazione Xq telomerica | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche | |
Duplicazione Xp22 | in genere “de novo” * | ** variabile a secondo degli studi e delle casistiche |